Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcn1E9PVA8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcn1E9PVA8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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