Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3543D3Z235 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3543D3Z235 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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