Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930467E23RikD3Z1P8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930467E23RikD3Z1P8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms