Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem200bD3Z0P8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem200bD3Z0P8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms