Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc13D3YV10 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc13D3YV10 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms