Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nxpe3B9EKK6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nxpe3B9EKK6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms