Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rd3lB2RV38 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rd3lB2RV38 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms