Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Apol7aB2RT54 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apol7aB2RT54 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms