Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Phf3B2RQG2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf3B2RQG2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms