Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uhrf1bp1B2KF50 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uhrf1bp1B2KF50 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms