Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H60cB1B213 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms