Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CK137956B1AYM9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CK137956B1AYM9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms