Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm438B1ASB3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms