Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Grik3B1AS29 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Grik3B1AS29 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grik3B1AS29 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms