Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprsB0V2N1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprsB0V2N1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms