Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Supt3B0QZW4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Supt3B0QZW4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms