Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M5A7VMS3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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