Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ttll11A4Q9F4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttll11A4Q9F4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms