Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palm3A2TJV2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palm3A2TJV2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palm3A2TJV2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palm3A2TJV2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palm3A2TJV2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palm3A2TJV2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palm3A2TJV2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palm3A2TJV2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palm3A2TJV2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palm3A2TJV2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Palm3A2TJV2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Palm3A2TJV2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Palm3A2TJV2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms