Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga8A2ARA8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itga8A2ARA8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms