Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rtf1A2AQ19 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtf1A2AQ19 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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