Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930447F04RikA2AFR2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms