Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtprfA2A8L5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtprfA2A8L5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PtprfA2A8L5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms