Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prdm2A2A7B5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prdm2A2A7B5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms