Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap29-1A2A5X4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms