Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam71e1A1L3C1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam71e1A1L3C1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms