Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Frmpd3A0A140LIW3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd3A0A140LIW3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms