Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms