Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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