Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Trbv26A0A0B4J1P5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Trbv26A0A0B4J1P5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv26A0A0B4J1P5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Trbv26A0A0B4J1P5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trbv26A0A0B4J1P5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trbv26A0A0B4J1P5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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