Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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