Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm5893-201ENSMUST00000135286 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Sms-201ENSMUST00000112529 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.1 ms