Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Apoc2-202ENSMUST00000134116 569 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm2866-201ENSMUST00000166053 481 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm17074-201ENSMUST00000167284 556 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Sfta2-202ENSMUST00000174521 649 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm26817-201ENSMUST00000180446 339 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm27150-201ENSMUST00000183441 1038 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm27228-201ENSMUST00000184500 1038 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Kcna2-202ENSMUST00000196403 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC123935.1-201ENSMUST00000225588 409 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Tssk4-207ENSMUST00000228395 1273 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AA986860-201ENSMUST00000039323 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Trim13-201ENSMUST00000039562 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Igsf1-202ENSMUST00000072037 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 2010109I03Rik-201ENSMUST00000077004 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Cdk12-202ENSMUST00000107538 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Sec31a-210ENSMUST00000182886 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Mcf2l-201ENSMUST00000095456 3926 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Sub1-201ENSMUST00000022816 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Dpf3-207ENSMUST00000178756 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Nup107-202ENSMUST00000167943 3098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Adgrf4-203ENSMUST00000167993 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Plekhb2-203ENSMUST00000156687 5176 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 P2rx7-204ENSMUST00000121489 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Mertk-201ENSMUST00000014505 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm37198-201ENSMUST00000195593 2110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 BB014433-201ENSMUST00000050493 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 D430036J16Rik-202ENSMUST00000181447 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm5743-202ENSMUST00000212004 1647 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Sp1-202ENSMUST00000163709 3134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Ckap2l-201ENSMUST00000052708 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm37398-201ENSMUST00000191914 1466 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Cdh16-213ENSMUST00000212882 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Trcg1-201ENSMUST00000093837 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Dusp27-202ENSMUST00000192369 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm11239-201ENSMUST00000171348 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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LtbrP50284 Gm11236-201ENSMUST00000180092 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm428-201ENSMUST00000084475 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Eml1-202ENSMUST00000109857 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm5760-201ENSMUST00000119692 1002 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LtbrP50284 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms