Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tpd52l2-201ENSMUST00000000844 2950 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v0e-202ENSMUST00000167352 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rtel1-204ENSMUST00000108814 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Usp17lb-202ENSMUST00000106814 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cavin2-201ENSMUST00000051572 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Prokr2-203ENSMUST00000110157 4005 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm12093-201ENSMUST00000120906 1405 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Zfp873-204ENSMUST00000210325 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Syncrip-211ENSMUST00000174688 3176 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Fam166b-202ENSMUST00000107928 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ccl25-204ENSMUST00000110982 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm11489-201ENSMUST00000118342 499 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm12925-201ENSMUST00000130791 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 4833417C18Rik-201ENSMUST00000146868 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Nip7-202ENSMUST00000170962 606 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 1700019P21Rik-201ENSMUST00000186955 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm7761-201ENSMUST00000190510 921 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1398-ps1-201ENSMUST00000193866 929 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Lrrc43Q3V0L5 AC120386.1-201ENSMUST00000213434 736 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Elof1-205ENSMUST00000216837 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr460-201ENSMUST00000051540 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Defb23-201ENSMUST00000099206 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Myo19-201ENSMUST00000020837 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Nadk-202ENSMUST00000105612 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cnbd2-203ENSMUST00000109580 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Lrrc43Q3V0L5 1700017G19Rik-201ENSMUST00000035860 2437 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpk-201ENSMUST00000043269 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm14139-201ENSMUST00000109926 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Pdcl-201ENSMUST00000009174 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Jarid2-210ENSMUST00000173704 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 1810053B23Rik-204ENSMUST00000185971 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Vsnl1-201ENSMUST00000072299 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Dync1i2-203ENSMUST00000112136 2548 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Clec7a-201ENSMUST00000112076 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Crat-203ENSMUST00000102855 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm20744-201ENSMUST00000208972 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Lyg1-202ENSMUST00000114894 798 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms