Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Cyp17a1-201ENSMUST00000026012 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nphp4P59240 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms