Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
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