Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tcl1b4-201ENSMUST00000000718 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ift46-202ENSMUST00000118186 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Mtmr6-203ENSMUST00000224366 1968 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 5430416N02Rik-201ENSMUST00000180779 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Trim35Q8C006 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 4931406B18Rik-202ENSMUST00000163474 726 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm17800-201ENSMUST00000182466 971 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm21249-201ENSMUST00000187380 696 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm29725-201ENSMUST00000206614 407 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trim35Q8C006 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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