Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Zwilch-201ENSMUST00000122091 2957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Lepr-202ENSMUST00000102777 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Def8-205ENSMUST00000108832 3242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Def8-201ENSMUST00000001522 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 B020018J22Rik-201ENSMUST00000223085 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rnf43-201ENSMUST00000040089 3670 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tll2-202ENSMUST00000169941 3318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm42444-201ENSMUST00000199366 4558 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rpl23a-ps3-201ENSMUST00000104925 468 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm11999-201ENSMUST00000145789 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm8065-201ENSMUST00000164048 605 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm29444-201ENSMUST00000187152 1156 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Igkv9-119-201ENSMUST00000200307 353 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Cenpx-202ENSMUST00000055424 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm10335-201ENSMUST00000096020 468 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm10132-201ENSMUST00000099431 468 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 I830077J02Rik-201ENSMUST00000098758 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC165260.6-201ENSMUST00000225447 1735 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr381-203ENSMUST00000214623 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 St7-201ENSMUST00000000674 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Atp2c1-212ENSMUST00000176770 2781 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tex11-203ENSMUST00000113718 3278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Meis2-201ENSMUST00000028639 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37354-201ENSMUST00000193333 2384 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 C6-204ENSMUST00000162585 2876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gsta3-201ENSMUST00000027067 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Extl2-201ENSMUST00000029575 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ttyh1-206ENSMUST00000129423 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Eif2d-201ENSMUST00000068791 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Hnrnpk-224ENSMUST00000224182 2754 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm11346-203ENSMUST00000135889 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr1491-206ENSMUST00000216622 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Psmb11-201ENSMUST00000097177 4247 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm43376-201ENSMUST00000198939 1887 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm5997-201ENSMUST00000208154 1864 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Panx3-201ENSMUST00000011262 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Plp1-202ENSMUST00000113085 2540 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm14188-201ENSMUST00000105060 168 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm13651-201ENSMUST00000119086 1110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Slc15a2-205ENSMUST00000164579 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm29336-201ENSMUST00000186042 573 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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