Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Ablim1-203ENSMUST00000104902 5907 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Adcy9-202ENSMUST00000117801 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm28972-201ENSMUST00000186990 2167 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 AC159379.2-201ENSMUST00000220244 2482 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm26748-201ENSMUST00000180406 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Slco2b1-203ENSMUST00000107088 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Btn2a2-203ENSMUST00000110433 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Nek6-201ENSMUST00000054234 10338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm44503-201ENSMUST00000149692 4383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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