Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 AC153821.1-203ENSMUST00000218105 607 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 AC165157.2-201ENSMUST00000222265 367 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 AC101831.1-201ENSMUST00000228245 691 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm826-201ENSMUST00000099127 637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TtrP07309 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Elavl2-203ENSMUST00000107109 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Elavl2-205ENSMUST00000107111 1552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Igkv14-130-201ENSMUST00000103307 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm26209-201ENSMUST00000103852 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm14419-201ENSMUST00000108975 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm15646-201ENSMUST00000143317 766 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Kcnd3os-202ENSMUST00000143893 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm12746-201ENSMUST00000151369 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm7577-201ENSMUST00000182543 982 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm17978-201ENSMUST00000195986 769 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 AC108846.3-201ENSMUST00000214078 247 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm6150-201ENSMUST00000217775 577 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Olfr319-201ENSMUST00000076965 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm23037-201ENSMUST00000083874 324 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Snora57-201ENSMUST00000093658 148 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TtrP07309 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms