Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Gm15251-201ENSMUST00000177947 883 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Dhcr7-207ENSMUST00000141916 2752 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Upk3aQ9JKX8 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm11756-202ENSMUST00000107312 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Upk3aQ9JKX8 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Upk3aQ9JKX8 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Upk3aQ9JKX8 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Upk3aQ9JKX8 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Upk3aQ9JKX8 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Upk3aQ9JKX8 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Upk3aQ9JKX8 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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