Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm26070-201ENSMUST00000157500 137 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Cstf3Q99LI7 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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