Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Stil-201ENSMUST00000030490 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms