Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm29807-201ENSMUST00000220161 372 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Limk2-204ENSMUST00000110029 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Hist2h2be-201ENSMUST00000090781 2620 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr92-203ENSMUST00000216341 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gpr83-202ENSMUST00000115624 2937 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 F730016J06Rik-202ENSMUST00000128888 3699 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm16026-206ENSMUST00000163068 2741 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Adgrf4-201ENSMUST00000024711 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm14648-201ENSMUST00000119328 483 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Rpl21-ps15-201ENSMUST00000121545 483 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 1700063K16Rik-202ENSMUST00000191341 952 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC151982.1-201ENSMUST00000223546 464 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Rpl21-ps7-201ENSMUST00000077420 483 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Frk-201ENSMUST00000019913 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC123619.1-203ENSMUST00000225276 2757 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm8314-201ENSMUST00000208964 1858 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gucy1b3-204ENSMUST00000193597 3171 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 C9-201ENSMUST00000022749 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Tdpoz1-201ENSMUST00000094413 2237 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Lias-201ENSMUST00000031101 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Tbc1d8b-201ENSMUST00000096313 5094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Asns-201ENSMUST00000031766 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Prpf40a-201ENSMUST00000076313 7374 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC164437.4-202ENSMUST00000228794 2413 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr1312-202ENSMUST00000213582 2891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Prdm2-201ENSMUST00000105778 7304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC117245.4-202ENSMUST00000214403 3816 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm10101-202ENSMUST00000181311 2919 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Mns1-201ENSMUST00000034746 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AI182371-206ENSMUST00000226631 1680 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Arhgdib-203ENSMUST00000111892 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms