Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Phactr1-205ENSMUST00000128646 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Cyp4a29-201ENSMUST00000118278 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm12425-201ENSMUST00000119580 363 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm5388-201ENSMUST00000120059 1117 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Rps10-ps4-201ENSMUST00000120308 492 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm12751-201ENSMUST00000122336 381 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm11454-201ENSMUST00000144092 714 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm17068-201ENSMUST00000163135 980 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 BC048671-202ENSMUST00000167550 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Ear6-202ENSMUST00000169070 893 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Guk1-205ENSMUST00000170895 743 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm8257-203ENSMUST00000179215 489 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm28419-201ENSMUST00000189108 475 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm38242-201ENSMUST00000192354 430 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm45271-201ENSMUST00000211017 919 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm8278-201ENSMUST00000222840 1121 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm10272-201ENSMUST00000092371 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Scfd1-205ENSMUST00000219434 2749 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Wdr12-203ENSMUST00000122038 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Clca2-201ENSMUST00000040465 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Trim39-205ENSMUST00000173369 2914 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf217D3YYI7 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms