Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Ssxb8B1AY40 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Ssxb8B1AY40 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Ssxb8B1AY40 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Ssxb8B1AY40 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ssxb8B1AY40 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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Ssxb8B1AY40 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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Ssxb8B1AY40 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Ssxb8B1AY40 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Ssxb8B1AY40 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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Ssxb8B1AY40 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Ssxb8B1AY40 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Ssxb8B1AY40 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ssxb8B1AY40 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ssxb8B1AY40 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ssxb8B1AY40 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ssxb8B1AY40 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ssxb8B1AY40 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ssxb8B1AY40 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ssxb8B1AY40 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ssxb8B1AY40 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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