Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm2897-201ENSMUST00000166494 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC160405.2-201ENSMUST00000219008 1987 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm13784-201ENSMUST00000119639 519 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Btg4-202ENSMUST00000213117 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Riok3Q9DBU3 Atp7b-201ENSMUST00000006742 6505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm16206-201ENSMUST00000132485 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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