Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Olfr169-204ENSMUST00000216070 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm12394-201ENSMUST00000107981 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms