Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
P18533 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
P18533 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P18533 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
P18533 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms