Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Sltm-201ENSMUST00000049263 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Clcn3-205ENSMUST00000110302 3768 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Zfp866-201ENSMUST00000131784 2680 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm17867-201ENSMUST00000188981 391 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr806-203ENSMUST00000215142 3108 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Ube2l3-202ENSMUST00000115699 2906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Prss35-202ENSMUST00000179574 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr554-203ENSMUST00000215995 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Lpar1-202ENSMUST00000107570 3244 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Dubr-205ENSMUST00000191079 2105 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Acp1-201ENSMUST00000062740 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 8430436N08Rik-201ENSMUST00000129988 1077 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm43711-201ENSMUST00000195994 373 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 1810014B01Rik-205ENSMUST00000218691 323 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Usp9yF8VPU6 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms